香港公司是‌‌境外公司，內地公司是境內公司這個是‌‌本質、基本的區別。正是因為這個原因導致了以下的區別：
1、辦公地址：香港公司注冊后可以不在香港實地辦公，不需要去租辦公室。大陸外貿公司如果有退稅現在注冊有實際地址，如果沒有退稅可以選擇地址。
2、雇用員工：香港公司注冊后，因為不用在香港實地辦公，當然你也可以不去雇用員工，即使是SOHO家庭辦公都可以。直接用香港公司接單和收款即可。大陸公司目前也可以不同雇傭員工。
3、注冊資金：香港公司注冊資金不用驗資到位，低1萬港幣，只是代表股東的經濟責任。大陸外貿公司現在注冊也是認繳制的，看自己需要填寫。
4、賬戶性質：香港本身是境外公司，所以以后開設的賬戶不管是大陸離岸帳戶還是香港本地賬戶，都是不受大陸外匯管制的境外賬戶性質。可以自由接收境外客人的貨款，轉到國外賬戶，沒有限制。如果轉入大陸公司賬戶那么等同于境外外匯入境，大陸企業可以去辦理核銷和退稅。利潤部分留存在賬戶中也可以轉入大陸個人外匯賬戶，然后結匯使用。
如果你有資金需要轉到境外，那么也可以直接轉出，不需要外管局審批方便用匯。這個是與大陸公司的賬戶的區別，也是很多朋友利用香港公司操作的主要目的。
5、稅務區別：香港公司稅種少，稅率低，沒有增值稅和營業稅，主要的稅種就是利得稅(相當于國內所得稅，8.25%-16.5%的稅率)。并且稅制適用的是“地域來源征稅原則”，也就是“業務不在當地運作，利潤來源自海外”可以申請豁免利得稅。除了可以免稅以外，香港公司的報稅周期也與大陸不同，是成立公司后次18個月報稅，以后是1年1次，時間非常長。而大陸公司，稅種比較多有增值稅、營業稅和所得稅，所得稅這塊的報稅1個月就要做1次，并且有利潤的馬上要交稅。所得稅25%稅率非常高